Visi Program Pascasarjana Unisma adalah:

Pascasarjana yang unggul bertaraff Internasional, Berorientasi masa depan, dalam bidang pengkajian Islam, Sains dan Teknologi serta budaya berdasar Ahlussunnah wal jamaah

Misi Program Pascasarjana Unisma adalah:

• Menyelenggarakan pendidikan program magister dan doktor yang profesional, berkualitas, dan kompetitif pada tingkat nasional dan internasional untuk menghasilkan sumber daya yang berkualitas, berdaya saing, dan berakhlaqul karimah berlandaskan Islam Ahlussunnah wal Jama’ah.
• Mengembangkan penelitian dan praktik profesional untuk menghasilkan karya inovatif di bidang ilmu pengetahuan, teknologi, seni, dan budaya yang bermanfaat bagi kemaslahatan umat
• Mengembangkan pengabdian kepada masyarakat berbasis penelitian sesuai bidang keilmuan yang berpihak pada kemaslahatan umat melalui pendekatan interdisipliner, multidisipliner, dan transdisipliner.
• Mengembangkan jejaring kemitraan yang bersinergi dengan berbagai pihak untuk meningkatkan pelaksanaan tridarma perguruan tinggi dengan tata kelola yang baik (good university governance) menuju program pascasarjana berstandar nasional dan internasional.